公司控股股东为海南机场集团有限公司，实际控制人为海南省国有资产监督管理委员会。作为海南省最大的国企上市公司平台，公司灵活统筹体制融合与机制创新，既拥有国企规范化管理体系，又兼具本身专业化、市场化优势，不断提升公共服务能力和品质， 强化对外资源拓展和内部资源协同发展,聚焦优势资源实现跨越式高质量发展。
截至2024年7月25日，胡丹锋先生、华铁恒升、大黄蜂控股及公司股东黄建新先生通过协议方式转让给海控产投的无限售流通股275,134,136股股份的相关过户登记手续已办理完毕，并取得了中国证券登记结算有限责任公司出具的《证券过户登记确认书》。本次股份转让完成后，海控产投直接持有上市公司275,134,136股股份，占公司股份总数的13.96%，成为公司第一大股东。公司控股股东变更为海控产投，实际控制人变更为海南省国有资产监督管理委员。
公司原控股股东北京东方君盛投资管理有限公司所持海南椰岛股票被司法拍卖导致其股份减少，公司第一大股东变更为国资公司。2023年6月28日，公司召开2023年第四次临时股东大会，会议审议通过了国资公司提名的2名董事。根据公司章程规定，公司董事会由9名董事组成，截至本公告披露日，由国资公司提名并当选的董事有5名，占公司董事会成员半数以上，因此导致公司控股股东及实际控制人变更，变更后公司控股股东为国资公司，实际控制人为海口市国有资产监督管理委员会。
公司控股股东为海南省交通投资控股有限公司，实际控制人为海南省人民政府国有资产监督管理委员会。
公司控股股东为海南省发展控股有限公司，实际控制人为海南省国有资产监督管理委员会。
公司控股股东为海南海汽投资控股有限公司，实际控制人为海南省国有资产监督管理委员会。
公司控股股东为海南省农垦投资控股集团，实际控制人为海南省人民政府国有资产监督管理委员会。