来源 :诺唯赞生物2023-04-26
一、测试方案
概述
诺唯赞基于TruePrep Flexible DNA Library Prep Kit for Illumina（Vazyme #TD504）和TruePrep RNA Library Prep Kit for Illumina（Vazyme #TR501/TR502/TR503）分别构建了模拟感染样本的转座酶DNA文库（293细胞gDNA模拟宿主核酸背景且分别掺入不同比例的Zymo #D6322微生物DNA标准品）和转座酶RNA文库（293细胞Total RNA模拟宿主核酸背景且分别掺入不同比例的微生物RNA），这两种文库下文中以微生物DNA文库和微生物RNA文库简述。
使用华大智造MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序仪对构建好的微生物DNA文库和微生物RNA文库进行测序。
表1.微生物DNA文库构建方案
注：Zymo #D6322由2%的Sac. cerevisiae和均占比14%的Staphylococcus aureus、Escherichia coli、Listeria monocytogenes、Pseudomonas aeruginosa、Enterococcus faecalis、Salmonella enterica、Bacillus subtilis共计8种微生物DNA组成
表2.微生物RNA文库构建方案
二、测试结果
1.测序数据质量表现优异
微生物DNA文库和微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量好，Clean Q30均能达到90%以上。
图1.微生物DNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量
图2.微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量
2.微生物检出灵敏
微生物DNA和微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的微生物检出reads数与实际掺入基本一致，两测序仪器对微生物DNA和微生物RNA在1/10000掺比下均能有效检出。
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图3.微生物DNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下
微生物检出情况
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图4.微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下
微生物检出情况
总结
Vazyme #TD504构建出的微生物DNA文库和Vazyme #TR501/TR502/TR503构建出的微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99两款测序仪器上均能实现微生物1/10000掺比下的灵敏检出，并且文库测序数据表现优异。
三、解决方案
诺唯赞mNGS转座酶建库解决方案
病原微生物引起的感染性疾病发病速度快、危害性强，快速确认重症感染患者所染病原体是临床进行有效治疗的关键。mNGS技术不依赖传统微生物培养，直接对核酸进行高通量测序，为临床样本病原微生物检测提供更快速、更准确的方式。围绕临床病原样本mNGS检测的迫切市场需求，诺唯赞精心打磨、提供更专业的产品与解决方案，助力临床诊疗。
华大智造DNBSEQ-G99测序平台
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四、订购信息
